Si el catálogo ya disponible en 3DS tiene suficientes títulos atrayentes para ti y no quieres esperar por la hipotética emulación en Switch, considero que por ahora 3DS sigue siendo mejor opción como consola portátil. Además la posible emulación de títulos de 3DS y DS en Switch no va a ser muy distinta a como lo harías con los emuladores disponibles en android usando un tablet/smartphone o como la emulación de juegos de DS en Wii U usando el gamepad.
No me parece una mala opción comprar ahora la 3DS junto a los juegos que te interesen y en 12, 18 o 24 meses considerar comprar Switch (quizás un modelo mejorado y/o con más memoria interna) si el catálogo ya tiene suficientes títulos que lo justifique, sean exclusivos o simplemente por tenerlos en modo portátil.
Quien decide eres tú, así que mira al catálogo de ambas consolas, qué es lo que quieres jugar y decide en función de qué sistema te ofrece los títulos de mayor interés para ti.